Le Viaur prend sa source dans le Parc Naturel Régional des Grands Causses au Puech Del Pal (1155 m - St laurent du Lévézou) sur le plateau du Lévézou, il fait aussi office de frontière entre l'Aveyron et le Tarn en aval. Il est franchi par deux viaducs, le viaduc ferroviaire du Viaur qui le domine de 120 mètres et le viaduc autoroutier à Tanus. Il se jette dans la rivière Aveyron en rive gauche, à Laguépie dans le département de Tarn-et-Garonne (82).

Le débit moyen annuel du Viaur, calculé sur 71 ans à Laguépie (de 1937 à 2007), est de 15,2 m³ par seconde pour une surface de bassin de 1 530 km². La rivière présente d'importantes fluctuations saisonnières de débit, avec des crues hiver-printemps de 20,7 à 31,7 m³, de décembre à avril inclus et maximales en février, et un étiage prononcé de fin d'été - début d'automne, de juillet à octobre, caractérisé par une baisse du débit moyen mensuel jusqu'à 2,80 m³ au mois de août.

Dans les années 1950, de nombreux barrages hydroélectriques ont été construits sur son cours, dont celui de Pont de Salars,  et sur ses affluents afin d'en recueillir l'eau pour la faire chuter vers le Tarn (Usine du Pouget, 400 m de dénivelé).